Az Agrár és Élelmiszeripari Kutató Központ (SZE-AÉKK) legfőbb célja, hogy a mezőgazdasággal és az élelmiszeriparral (élelmiszertudománnyal) összefüggő kutatási tevékenységeket szervezi. A Központ részt vesz a releváns K+F+I pályázatok megírásában és végrehajtásában. A SZE-AÉKK koordinálja az agrár- és élelmiszeripari kutatások és vállalati együttműködések kiszolgálását biztosító laboratóriumok (pl. víz-, talaj-, takarmány- és élelmiszerminták fizikai-, kémiai és mikrobiológiai vizsgálata) működését. A Központ stratégiai célja olyan innovatív kutatóegységek kialakítása, melyek a precíziós élelmiszer-előállító termékpályához kötődő gyakorlatorientált oktatási és kutatási feladatok támogatását segítik elő.